Vremea si ciclurile biologice schimba, pe parcursul anului, aspectul zonei Canionul Cotahuasi si posibilitatile de explorare. Sezonul secetos din mai pana in octombrie ofera cele mai fiabile drumuri si vedere la munte clara. Noptile sunt reci la altitudine chiar si cand fundul canionului e cald. Ploaia de vara intareste cascadele si vegetatia, dar poate perturba transportul prin alunecari de teren si traversari ale raului.
Perioada recomandata pentru vizitare este mai - oct.; sezonalitatea este un factor important in planificare. In afara acestei perioade, verifica vremea, durata zilei, programul transportului rutier sau al feriboturilor si eventualele inchideri sezoniere inainte de a fixa itinerarul.
Distantele, disponibilitatea combustibilului si a alimentelor, precum si acoperirea retelelor mobile pot fi mai putin previzibile decat sugereaza harta. Descarca harti pentru utilizare fara internet si lasa o marja de timp in program.
Situat in cadrul geografiei sale mai largi, Canionul Cotahuasi nu este o exceptie izolata. Pentru Canionul Cotahuasi, contextul mai larg arata ca, Cotahuasi apartine unei retele de vai adanci de-a lungul muntilor Arequipa, inclusiv Colca si platoul vulcanic. Pentru Canionul Cotahuasi, compararea acestora releva diferite modele de asezare, turism si gestionarea apei in aceeasi regiune a Andinelor.