Anotimpurile fac parte din evolutia peisajului, nu sunt doar un detaliu al planificarii calatoriei. Ploaia este posibila in fiecare sezon. Primavara si toamna ofera adesea o culoare puternica a padurii si temperaturi moderate; vara este umeda si poate aduce furtuni puternice, in timp ce iarna plaseaza zapada pe varfuri mai inalte chiar si atunci cand coasta ramane usoara. Usurarea verticala a insulei inseamna ca mai multe anotimpuri pot aparea imediat.
Perioada recomandata pentru vizitare este mar. - nov.; sezonalitatea este un factor important in planificare. In afara acestei perioade, verifica vremea, durata zilei, programul transportului rutier sau al feriboturilor si eventualele inchideri sezoniere inainte de a fixa itinerarul.
Feriboturile, tunelurile si vremea pot schimba ordinea opririlor dintr-o zi. Construieste itinerarul in jurul celei mai rare legaturi de transport, nu al celui mai apropiat punct de belvedere.
Privit in contextul regiunii, peisajul din zona Yakushima nu este un caz izolat. Yakushima apartine Insulelor Osumi si se afla de-a lungul unui lant care leaga Kyushu cu arhipelagul Ryukyu. In apropiere Tanegashima are un peisaj foarte diferit, inferior, ceea ce face contrastul intre insulele invecinate mai ales clar.